По семейным обстоятельствам вынужден был уехать на 2 недели, какие медицинские справки мне нужно предъявить в институте, чтобы оправдать отсутствие?

Вам нужно предъявить в ваше учебное заведение медицинские справки о временной нетрудоспособности. Так как срок вашего отсутствия на занятиях составил две недели, вам достаточно будет оформить медицинские справки по форме 095 (справка о временной нетрудоспособности), кроме того, вы можете получить освобождение от уроков физкультуры на 10 дней, что тоже будет не лишним.